当人们服用药物时，这些药物及其代谢产物可以被排泄并进入废水处理厂。从那里开始，这些化合物最终会进入水道。制药公司的废水可能会以更多的这些物质开始。在ACS的《环境科学与技术》中，研究人员报告说，单一的制药厂可能会影响欧洲最重要的河流之一的水质。
来自家庭和制药厂的废水通常流向处理厂。水中的某些化合物可能具有生物活性，有毒或持久性，但是在将处理后的水排入溪流或河流之前，污水处理厂无法始终去除所有物质。对于制药行业的水污染程度知之甚少，部分原因是公司通常不披露有关其生产活动或所使用化合物的身份的详细信息。瑞士联邦水生科学技术研究所的Heinz Singer和同事(称为Eawag)想比较瑞士莱茵河附近的两家处理厂排放的废水中的化合物：一种仅接收家庭和小型家庭的生活废水(WWTP_dom)。业务，
在三个月的时间里，研究小组每天从工厂收集处理过的废水样品，并使用高分辨率质谱仪分析其中的物质。由于制药行业通常会按时间间隔生产单批次的药物，因此研究人员寻找的化合物显示出较大的差异。他们从WWTP_ind中发现的水中高度可变的化合物比从WWTP_dom中发现的更多。研究小组确定了25种化合物是制药业相关物质，包括抗抑郁药和阿片类药物，并且WWTP_ind的水中的峰值含量远高于仅处理生活污水的工厂中的含量。研究人员还在莱茵河下游60英里处发现了其中几种物质，其含量与WWTP_ind的含量相关。
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