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研究人员开发了可药物融合靶标的新数据库

导读 当来自两个独立基因的片段由于各种因素(例如易位或剪接)而合并时,形成的杂交体称为基因融合体。近年来,已经发现这些融合事件在癌症和其他

当来自两个独立基因的片段由于各种因素(例如易位或剪接)而合并时,形成的杂交体称为基因融合体。近年来,已经发现这些融合事件在癌症和其他复杂疾病的发展中起着至关重要的作用。但是,很少有资源可以整理所有这些信息并在一处使用。通过从公开数据中分析超过一百万个核酸序列,由Bar-Ilan大学Azrieli医学学院的Milana Frenkel-Morgenstern博士领导的研究小组鉴定出111582个融合体,涉及8种物种(人,小鼠,大鼠,果蝇,野猪,斑马鱼,酵母和牛)。

该数据库的最新和最新版本称为ChiTaRS,刚刚在科学期刊《核酸研究》上发表。该数据库目前由萨法德市阿兹列里医学院的癌症基因组学和复杂疾病生物计算实验室维护,对于专门研究复杂疾病尤其是癌症,阿尔茨海默氏病,精神分裂症和许多其他疾病的临床医生而言,该数据库将非常有用。

此版本的ChiTaRS收集可药物治疗的融合靶标案例。近年来,这些融合基因中的许多已作为特定靶标,特别是对于化学治疗药物。一些通常已知的例子包括慢性小粒细胞白血病(CML)中的BCR-ABL1融合和非小细胞肺癌(NSCLC)中的EML4-ALK嵌合体。ChiTaRS 5.0提供了800多种可融合药物的列表,将近120种药物或药物组合用作靶标,可用于复杂疾病的个性化治疗。

该资源将为研究人员确定嵌合体/融合物在致癌作用中的功能性研究提供福音。在3D染色质图谱和进化生物学等领域,这也将是有利的。这是Frenkel-Morgenstern教授研究小组的最新资源,该小组已经维护了在线资源,例如用于融合文本挖掘的服务器(ProtFus)和融合蛋白与蛋白质的相互作用(ChiPPI)。

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