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模型预测蝙蝠物种有可能在传播致命的尼帕病毒

导读自1999年发现Nipah病毒以来,几乎每年都在东南亚报道,孟加拉国和受到的打击最为严重。在今天发表在PLoS被忽视的热带病中的一项新研究中,

自1999年发现Nipah病毒以来,几乎每年都在东南亚报道,孟加拉国和受到的打击最为严重。在今天发表在PLoS被忽视的热带病中的一项新研究中,科学家利用机器学习来识别可能存在尼帕病毒的蝙蝠物种,重点是 - 2018年爆发的地点。四种新的蝙蝠物种被列为监测重点。

Barbary Han是卡里生态系统研究所的疾病生态学家,他是该论文的共同主要作者。她解释说,“虽然越来越多的人认识到蝙蝠在东南亚传播尼帕病毒方面发挥了作用,但人们对哪种物种造成的风险最大化知之甚少。我们的目标是帮助确定更有可能携带的物种。 Nipah,旨在监控并保护公众健康。“

蒙大拿州立大学的疾病生态学家Raina K. Plowright也是共同的主要作者。她指出,“正如本文即将发布的那样,在喀拉拉邦证实了另一例尼帕病毒。公共卫生界再次被迫进入反应模式。我们的研究是开展遏制尼帕的研究的起点。所以我们正在管理溢出风险,而不是人类的痛苦。“

Nipah病毒是一种高度致命的新兴的henipavirus,可以通过感染蝙蝠的体液传播给人们。被蝙蝠污染的水果或枣椰树汁被标记为传播途径。一旦被感染,人们就可以将病毒直接传播给其他人,从而引发爆发。家猪也是可以感染人类的​​桥接宿主。没有疫苗,病毒的死亡率很高。

“世界各地都发现了蝙蝠传播的病毒,但监测和抽样工作一直不完整,”韩说。“可能有很多有能力的Nipah主机尚未被确定。因此,需要设计新方法,将所有可用数据考虑在内,以指导和其他地区的抽样工作。”

估计有113种蝙蝠。这些物种中只有31种已被采样用于Nipah病毒,其中11种具有发现宿主潜力的抗体。Plowright指出,“鉴于蝙蝠在传播病毒感染人类方面的作用,对这些动物的理解投入一直很低。最近一次对蝙蝠进行的全面系统的分类学研究是在一个多世纪前进行的。”

机器倾斜是一种人工智能,用于标记有可能庇护Nipah的蝙蝠物种。Han解释说:“通过观察已知在全球范围内携带Nipah的蝙蝠物种的特性,我们的模型能够预测居住在的其他蝙蝠物种是否有可能携带病毒并将其传播给人们。这些蝙蝠目前不是在公共卫生雷达上,值得进一步研究。“

首先,该团队编制了已知的蝙蝠物种的已公布数据,这些蝙蝠物种已在全球范围内携带尼帕和其数据包括523种蝙蝠物种的48个特征,包括有关觅食方法,饮食,迁徙行为,地理范围和繁殖的信息。他们还研究了报告的溢出效应发生的环境条件。

然后,他们将基于特质的机器学习方法应用于亚洲,澳大利亚和Oceana的一部分物种。他们的算法确定了已知的Nipah阳性蝙蝠物种,准确率为83%。它还确定了在亚洲,澳大利亚和Oceana发生的六种蝙蝠物种,它们的特性可以使它们成为主管,并应优先进行监测。其中四种物种出现在,其中两种物种存在于喀拉拉邦。

Plowright解释说,“我们开始对喀拉拉邦附近可能的烟草病毒库进行基于特征的预测。我们的重点是狭窄,但该模型成功识别尼帕主机,证明这种方法可以作为指导Nipah监视的有力工具。和其他疾病系统。“

作者指出,他们的预测必须结合当地的蝙蝠生态学知识 - 包括分布,丰度和与人类的接近程度 - 来设计可以有效识别对人类构成风险的蝙蝠宿主的抽样计划。这项工作提供了一个物种清单,以指导早期监测,不应被视为最终的水库清单。

“对高风险蝙蝠种群进行调查可以为兽医和公共卫生当局提供预警,以采取预防措施来预防爆发。确定哪些物种患有疾病是监测规划的重要第一步。我们还需要优先研究哪种病毒菌株对人们造成的风险最大。最终,目标是消除风险,而不是扑灭火灾,“韩总结道。

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