小鼠是最常用的实验室生物之一,广泛用于研究从自闭症到传染病的所有事物。然而,小鼠的基因组研究落后于人类的基因组研究。
加利福尼亚大学圣地亚哥分校医学院精神病学教授亚伯拉罕·帕尔默(Abraham Palmer)博士说:“在过去的十年中,全基因组关联研究-将基因与疾病和其他特征相匹配-一直是人类遗传学中的一大难题。”“但是动物遗传学方面的进展还不是很大。这是因为研究人员一直在使用近交系之间的杂交,因此无法查明特定基因组区域或与性状相关的单个基因。此外,我们以前没有以经济有效的方式对动物进行基因分型的好方法。”
现在,在《自然遗传学》上发表的一项研究中,帕尔默的团队使用了1,200只与自然种群更相似的近交小鼠来测试一种新的具有成本效益的技术,以寻找与66种不同的身体和行为特征相关的特定基因。
帕尔默说:“该系统可用于发现与研究人员感兴趣的任何动物复杂特征相关的基因。”“我们可以研究任何特征并迅速发展有关特定基因的假设。这就像在人类中进行全基因组关联研究一样,但费用较低。而且,我们可以研究人类中不存在的某些特征。”
以前,只有染色体的较大区域才能与特定的小鼠特征或行为相关。帕尔默(Palmer)的方法利用了近交群体中存在的出色混合功能,可通过以下两个步骤帮助深入研究特定基因:逐个基因型测序,可对小鼠基因组进行约1%的测序;RNA测序,仅识别在特定组织(例如大脑)中“打开”的基因。
通过这种方法,研究人员发现了基因与其相关性状之间的众多关联。例如,他们报告说,小鼠基因Azi2与甲基苯丙胺对人体运动的影响有关,而小鼠基因Zmynd11与焦虑症行为有关。帕尔默说,这一发现可能与临床有关,因为人类具有类似的基因。
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