儿童癌症最常见的形式是急性淋巴细胞白血病(ALL)。瑞典隆德大学的研究人员与卡罗林斯卡医学院,SciLifeLab和剑桥大学合作,现在通过研究超过8 000种基因和蛋白质的活性,对蛋白质水平的ALL进行了迄今为止最广泛的分析。结果显示DNA串中的异常折叠,这反过来影响基因的活性。该研究最近发表在Nature Communications上。
大约25%的ALL患儿患有白血病,其特征是患病细胞含有过多的染色体,称为超二倍体。有时在一个细胞中发现多达67条染色体。
“我们之前已经证明,额外染色体上的基因通过变得更加活跃来控制白血病的发展。这会导致细胞不平衡,例如,可能会开始更快地分裂”,隆德副教授Kajsa Paulsson说。大学和该研究的最后一位作者。
但是,到目前为止,确切的工作机制还不清楚。在这项新的研究中,研究人员检测了超过8 000种基因和蛋白质的活性 - 这种形式以前从未在这种规模上进行过这种形式的癌症。
检查蛋白质的优点是它在生物学上更具相关性。Kajsa Paulsson解释说,如果只检查RNA水平然后转化为蛋白质水平,那么连接就不完全清楚了。
“这是一个较新的领域,检查蛋白质水平更加困难,但优势在于,与仅研究基因相比,它让我们更好地了解细胞是如何被控制的”,Karolinska Institutet and co教授JanneLehtiö说。 - 该研究的作者。
在超二倍体白血病中,研究人员注意到较低水平的CTCF蛋白和蛋白质复合物cohesin,它控制DNA串在细胞中的折叠方式,与没有额外染色体的白血病相比。因此,研究人员研究了DNA如何在超二倍体白血病中折叠,并且能够观察到一定比例的病例表现出异常折叠。
“如何折叠DNA对于调节基因何时活跃是非常重要的。我们还可以看到,超二倍体白血病显示基因失调的迹象,这可能有助于疾病的发作”,Kajsa Paulsson说。
持续研究将集中于确定显示异常折叠的DNA比例。该研究的结果对于了解超二倍体儿童白血病是如何产生以及驱动癌症过程的因素非常重要。
“今天,由于使用化疗进行广泛治疗,ALL患儿的治愈率达到90%。未来,我们希望能够开发更好的治疗方法,提供更好的治愈机会和更少的副作用。 “Kajsa Paulsson总结道。
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