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表观遗传学研究为癌症联合治疗提供了新方法

导读表观遗传过程使细胞能够通过调节基因的活动来响应环境的变化。其中一种在基因激活中起关键作用的蛋白质是BRD4,这是一种充分表征的表观遗传

表观遗传过程使细胞能够通过调节基因的活动来响应环境的变化。其中一种在基因激活中起关键作用的蛋白质是BRD4,这是一种充分表征的“表观遗传阅读器”,可与组蛋白和非组蛋白上的乙酰化赖氨酸残基结合。

为了测量细胞BRD4活性,奥地利科学院CeMM研究中心的Stefan Kubicek实验室在2016年生成了细胞报告系统。现在,研究人员能够应用该模型系统地测试是否有任何损失。大约23,000个人类基因中的一个类似于BRD4抑制。令人惊讶的是,他们发现了叶酸代谢与基因调控的相互作用。

该研究的结果,其中包括来自分子病理学研究所(IMP)和维也纳医科大学的科学家,现已发表在Nature Genetics期刊上(DOI:10.1038 / s41588-019-0413-z)。

现代全基因组筛选技术能够产生诱变细胞群,其中单个基因在每个细胞中被破坏。BRD4报告细胞使Cefan Kubicek在CeMM的实验室能够从这些细胞群中精确选择那些表现为BRD4被抑制的细胞。然后使用下一代测序来鉴定哪些基因被关闭。“我们原本期望找到一个经典的表观遗传因素,”库比塞克说,“所以我们更为惊讶的是,最好的打击是MTHFD1。”这种酶参与叶酸代谢,这是一个先前未与BRD4相关的过程。此外,MTHFD1主要位于细胞质中,而BRD4位于细胞核中。

巧合和偶然性为第一作者Sara Sdelci提供了另一个难题,证实了结果。在一次会议上,她在IMP的Johannes Zuber实验室会见了Philipp Rathert,他也在研究BRD4。Sara Sdelci:“Philipp Rathert已经得出数据显示MTHFD1也与BRD4物理结合。”在随后的实验中,她可以证明在细胞核中发现的小部分MTHFD1蛋白与BRD4相互作用。这种相互作用将MTHFD1募集到DNA中,其中酶有助于基因调节。

从叶酸代谢中发现BRD4和酶MTHFD1的相互作用有望在癌症联合治疗中用于治疗侵袭性肿瘤。抗叶酸,抑制叶酸循环的物质,已经在癌症治疗和类风湿性关节炎等疾病中使用了70多年。新研究表明,抗叶酸可与BRD4抑制剂结合,更有效地对抗肿瘤。结果也可能有助于对患者进行分层以确保治疗成功。Sara Sdelci的研究与BRD4依赖性肿瘤具有临床相关性。这包括具有导致BRD4过度表达的遗传畸变的肿瘤,以及BRD4通过其基因调节功能促进细胞生长的许多其他癌症。因此,制药公司已开发出高活性的BRD4抑制剂,目前正在临床试验中进行测试。在临床肿瘤学中,由于耐药性的发展,使用单一化学药剂的单一疗法很少成功。

在最好的情况下,根据我们的研究结果,也可以选择患者,因为他们的叶酸水平和遗传,对BRD4抑制剂反应特别好。“

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