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RNA测序用于发现乳糜泻的新基因和途径

导读在研究人员粘膜免疫与生物研究中心在大众婴幼儿专科儿童医院(MGHfC)发现新基因,并在腹腔疾病的发展和与疾病相关的炎症持续和合并症与早期

在研究人员粘膜免疫与生物研究中心在大众婴幼儿专科儿童医院(MGHfC)发现新基因,并在腹腔疾病的发展和与疾病相关的炎症持续和合并症与早期阶段的途径。发表于PLOS One的研究结果包括对患有和未患乳糜泻的个体的十二指肠活检中的RNA序列进行分析,并且与先前描述的乳糜泻发展途径一致。

与总部设在纽约Tarrytown的生物制药公司Regeneron Pharmaceuticals,Inc。合作,研究人员对12名患有活动性乳糜泻的患者进行了全转录组霰弹枪测序,15名患有缓解但没有肠道损伤的乳糜泻患者和15名没有乳糜泻的患者。通过分析参与者的转录组 - 转录RNA序列的总和 - 研究人员发现哪些基因被表达,哪些基因未被表达以确定与乳糜泻相关的遗传特征。

“我们知道乳糜泻是一种多因素疾病,约有57种基因与这种自身免疫疾病有关。通过进行RNA测序,我们发现了更多的遗传'特征',并更接近于确定未来治疗药物的目标 - 乳糜泻和其他可能的疾病自身免疫疾病,“医学博士Maureen Leonard,医学博士,MGHfC腹腔研究和治疗中心临床主任,哈佛医学院儿科学讲师,该研究的第一作者。

结果显示三组间基因表达存在明显差异。研究人员发现,在患有活动性乳糜泻和非乳糜泻对照的人群中,945基因的表达存在显着差异;缓解乳糜泻的人和非乳糜泻组之间的290个基因;缓解组中活动性腹腔组和乳糜泻之间的538个基因。

“鉴定出的基因激活了三种主要途径:先天免疫,肠道通透性和细胞成熟分化,”Alessio Fasano医学博士,MGHfC腹腔研究和治疗中心主任,哈佛医学院儿科教授和资深作者的PLOS一个报告。“当你患上乳糜泻时,我们可以证实这些功能是有用的。”他指出,当患者接受无谷蛋白饮食时,一些基因的表达恢复正常,有些则没有。法萨诺指出,这一发现可以提供一些见解,为什么有些人即使遵循严格的无麸质饮食也会持续肠道损伤。

从产生的大量数据中,研究人员选择关注功能性通路,这些通路在活动性腹腔组和缓解期之间存在显着差异。活动性腹腔组中三个最受扰动的途径中的两个涉及细胞因子和趋化因子的信号传导,其被称为免疫系统的“第一反应者”和疾病发展早期的先天免疫中的炎症标志物。研究人员还发现有证据表明共病自身免疫性疾病的风险在活动性乳糜泻中可能很高,因为1型糖尿病,狼疮和自身免疫性甲状腺疾病的途径也被上调。

确定乳糜泻和其他自身免疫疾病的治疗干预的潜在目标是该研究小组的长期目标。“这项研究只是一个开始。我们的研究结果为未来的验证研究提供了框架,以研究乳糜泻发病机制的早期步骤并检查缓解状态,”伦纳德说。目前正在其他研究中心进行研究,以便在炎症性肠病的靶向治疗中使用转录组,伦纳德和法萨诺希望将其复制用于乳糜泻。

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