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你怎么找到一个完全未知的病毒研究人员说看看基因组

导读 费城 - 病毒是地球上最丰富的生物实体,是人类的祸害,导致慢性感染和可导致数百万人死亡的全球大流行病。然而,感染人类的​​病毒的真

费城 - 病毒是地球上最丰富的生物实体,是人类的祸害,导致慢性感染和可导致数百万人死亡的全球大流行病。然而,感染人类的​​病毒的真实程度仍然是未知的。一些新发现的病毒因突然出现一种新疾病而被认可,例如2003年的SARS,甚至是20世纪80年代初的艾滋病毒/艾滋病。然而,新技术现在使科学家能够通过直接研究与人类相关的遗传物质中的RNA或DNA序列来识别病毒,从而能够检测整个病毒群体 - 称为病毒体 - 包括那些可能不会导致急性识别疾病的病毒。然而,

在研究中医药的佩雷尔曼学院在宾夕法尼亚大学,现在已经确定了先前未知的病毒家族,它原来是在人类肺癌和口腔标本的第二个最常见的DNA病毒,它与严重的重大疾病和相关牙龈疾病,分别。该团队今天在Cell Host Microbe上发表了他们的发现。资深作者,微生物学系主任Frederic D. Bushman博士和肺病,过敏和重症监护教授Ronald G. Collman博士领导发现这种新病毒的团队,他们称之为Redondoviridae。

“新的测序技术帮助我们揭开了一个新的病毒世界,”布什曼说。“然而,到目前为止,我们所拥有的大部分序列数据仍未分类,为了更好地了解人类病毒组织以及这些新物种如何与疾病相关,我们还有许多工作要做。”

研究小组分析了人肺部的样本,以自由漂浮的病毒颗粒为序列分析RNA和DNA。利用这一广泛的病毒序列调查作为起始点,将样本与公共数据库中的已知病毒序列进行比较,该团队,包括第一作者Arwa A. Abbas和Louis J. Taylor,都是与Bushman和Collman合作的研究生,短序列,类似于驯化猪粪中发现的一种病毒。从那里,他们确定了样本中的全基因组,他们认为这是一种全新的人类病毒。

该团队知道他们可能已经发现了一种病毒,因为DNA构建模块的序列 - 最终形成蛋白质 - 使他们能够将这些蛋白质识别为已知病毒分子的远亲,这对于制造病毒颗粒外壳和管理复制非常重要。 。

有了这种新病毒,他们就会在其他DNA序列数据中搜索它。在数据库中扫描了7,000多个样本后,他们发现了17个完整的红细胞病毒基因组,还有更多的部分序列。该搜索显示,这个小的环状DNA病毒家族与牙周炎有关 - 牙龈炎症。他们直接在患者样本中搜索它,并发现在重症监护病房(ICU)的危重病人的肺中,红细胞病毒也特别丰富。

科尔曼说:“总的来说,我们要问的是,我们是否可以采用未知的DNA序列并通过识别人类病毒体中整个序列的新病毒来理解它。”

该团队目前正致力于在实验室中培养红细胞病毒,以研究其生物学的基本问题,以及有关其与疾病关系的更多临床问题。他们希望这个方向有助于确定新病毒是否仅与疾病相关或是否会导致疾病,医生可能能够利用这些知识更好地帮助ICU患者和牙病。

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