银行账户年检时间在每年( )月( )日前(银行账户年检) 无道具晨会互动小游戏(无道具晨会互动小游戏室内) 黄昏英雄传攻略(黄昏英雄传2.5攻略) 双面胶怎么快速去除胶水(双面胶怎么快速去除) 苹果醋解酒么(苹果醋为什么可以解酒) 怎样关闭电脑杀毒软件和防火墙(怎样关闭电脑杀毒软件和防火墙联想) 莫斯科气温和我国哪里差不多(莫斯科气温) 魔兽世界:探索艾萨拉(魔兽世界 艾萨拉) hopes是什么意思(hope是什么意思) 孕妇可以吃杏仁吗?(孕妇可以吃杏仁吗?孕中期) 8k纸有多大比A3大多少(8k纸有多大) 武汉艺术生文化课到底该如何学习?(武汉艺术生文化课培优) 节奏大师攻略四个技巧刷高分(节奏大师怎样玩才高分) 受凉感冒是风热还是风寒(受凉) 地球的南极北极都是冰天雪地那月球的两极呢(北极和南极都是冰天雪地) 蛇蛇大作战电脑版攻略(蛇蛇大作战游戏下载) 什么是哑口套和窗套(什么是哑口) WIN10电流麦解决方法(win10电脑电流麦怎么解决方法) 平时多吃什么食物补肾效果最好(平时多吃什么食物补肾效果最好女性) 哈伦裤适合什么年龄穿(哈伦裤适合什么人穿) 魔兽世界前夕稀有精英位置一览 看完就知道了(魔兽世界9.0前夕稀有精英位置与掉落) 如何实现创业成功(如何实现创业成功发展) QQ空间如何添加大图模块(qq空间怎么添加图片模块) 梦幻西游挖矿赚钱(挖矿赚钱) 剖腹产的好处(剖腹产的好处有哪些) 如图已知ab为圆o的直径弦cd⊥ab垂足为h(如图 已知AB是圆O的直径 弦CD垂直AB 垂足为H) 深圳上下沙租房攻略(深圳下沙哪里租房便宜) 被2345和hao123主页篡改修复方法 2015(2345是怎样篡改主页的以及如何彻底删除) nba历史得分榜百度一下(nba历史得分榜百度百科) 如何防雾霾 什么口罩防雾霾效果好(什么口罩可以防霾) 制作手工的材料有哪些(制作手工的材料有哪些简单) 天使等级 北京商标注册流程图(北京商标注册流程图解析) Galaxy S4 发布 全面解析新旗舰 图(galaxy s4 上市时间) 土大黄根主要治什么病(土大黄与大黄的区别) vivo手机怎么定位(vivo手机怎么定位查找) dnf更新失败怎么办 安装文件写入失败怎么办(为什么dnf更新写入失败) 隔玻璃晒太阳能起作用(隔着玻璃晒太阳能补钙) steam国服怎么玩apex(steam国服怎么玩最终幻想14) 纳雍县是哪个市 蜂蜜可以放冰箱吗(蜂蜜可以放冰箱吗可以放多久) 电脑怎么连热点(联想电脑怎么连热点) 石器时代宠物攻略(石器时代宠物大全) 经济管理出版社地址(经济管理出版社) 芒果tv怎么看湖南卫视(芒果tv怎么看湖南卫视回放) iPhone13如何在微店购物?(iphone13直营店可以直接买到吗) 淘宝海外版叫什么(淘宝海外版) 幽门螺杆菌抗体(幽门螺杆菌抗体偏高是怎么回事) iOS7.1.1固件下载(ios7.0.4固件下载) 纸的来源视频(纸的来源)
您的位置:首页 >Nature杂志 > Nature杂志精选 >

可以使用突破性的开源软件实时跟踪神经活动

导读 由于宝贵的开源软件CaImAn,神经科学家将不再需要手工跟踪神经活动,CaImAn可以近乎人性的精确度自动化过程。 手动跟踪神经活动是一个费力

由于宝贵的开源软件CaImAn,神经科学家将不再需要手工跟踪神经活动,CaImAn可以近乎人性的精确度自动化过程。

手动跟踪神经活动是一个费力的过程,一些科学家使用钙成像在一小时内收集高达1TB的数据。但在1月份,eLife发表的一篇论文宣布,软件CaImAn(钙成像分析的缩写)可以实现近乎人性化的准确性,同时使整个过程自动化。

一位实验者可以在一天内填满市面上最大的硬盘,“

MichaelHäusser,伦敦大学学院神经科学家。

此外,在纽约Flatiron研究所,计算生物学中心(CCB)神经科学小组负责人Dmitri Chklovskii表示,“人们花费更多时间分析他们的数据,以提取活动痕迹,而不是实际收集它们。”

但是,不仅数据量可以压倒团队跟踪神经活动。识别单个神经元可能是一个非常具有挑战性的过程,来自不同神经元的荧光信号重叠并使过程混乱,以及来自脑组织本身的运动也使得难以使用钙成像追踪单个神经元。

钙成像使用与钙离子结合的染料,钙离子负责激活神经元。在紫外线下,染料被照射。染料必须与钙离子结合才能达到荧光,这样研究人员才能直观地追踪神经元的活动。

最新版本的CaImAn可用于标准笔记本电脑并实时分析数据,使研究人员可以在进行分析的同时进行实验。该软件采用标准计算方法和机器学习技术的混合。

该研究表明,CaImAn“提供自动和可扩展的方法来解决预处理常见的问题,包括运动校正,神经活动识别以及跨不同数据收集会话的注册。”它还通过“最小的用户干预”实现了所有这一切。 。

CaImAn的准确性是针对人类生成的数据集进行测试的。不仅证明软件几乎和人类一样准确,它也被证明更有效率。这种提高的效率使研究人员能够在实验过程中调整他们的实验,从而改进研究特定神经元群如何促成不同行为的研究。

CaImAn还解决了标准化图像数据分析的问题,数据集通常揭示了研究人员之间的差异。

基于机器学习的工具也是使用人工生成的数据集作为培训开发的。这些数据集可以公开获得,以便更广泛的研究团体进一步开发CaImAn并制作新工具。

超过100个实验室使用该软件,该软件已经免费提供多年。为了更好地管理由钙成像产生的令人难以置信的大型数据集,Dmitri Chklovskii启动了该项目,Eftychios Pnevmatikakis和Andrea Giovannucci后来领导了这项工作。

它最初是由Pnevmatikakis在哥伦比亚大学Liam Paninski实验室担任博士后开发的。

Pnevmatikakis说:

“它在数学上很优雅并且做得不错,但我们意识到它并没有很好地推广到不同的数据集。我们希望将其转变为社区可以使用的软件套装。“

加入CCB神经科学小组三年来进一步开发软件,Giovannucci说“现有的分析工具不足以解开这一群神经元的活动,并暗示他们都在做同样的事情。”他解释说,该软件是算法“减去背景声音并集中于少数几个。”

该软件适用于双光子和单光子成像,杜克大学神经科学家John Pearson说他的实验室“对能够使用这样的工具感到兴奋”。

标签:

免责声明:本文由用户上传,如有侵权请联系删除!