来自悉尼大学的癌症研究员Jennifer Byrne教授希望通过创建世界上第一个事实检查计划来改变这一点，该计划正在解决生物医学研究结果错误发布的问题，无论是有意还是无意。
在一篇发表于PLOS ONE的论文中，Byrne教授和法国格勒诺布尔阿尔卑斯大学的同事CyrilLabbé博士详细介绍了他们开发并向研究人员免费提供的事实检查计算机程序“Seek&Blastn”。
该程序通过在论文中寻找序列并通过迄今为止拥有丰富的基因知识的数据库运行它们来验证已发表的核苷酸序列试剂(用于靶向基因的DNA和RNA构建体)的身份。“生物医学试剂就像烹饪中的成分一样。你用它们来发现你的实验结果。用错误的试剂做一个实验，或者意味着你做的东西与你以前做的不同，或者你做的是失败的，”Byrne说。 ，悉尼医学院肿瘤内科教授。
“不幸的是，通过实验，失败并不总是像在厨房里一样明显。在这里，我们正在处理基础遗传研究，其他研究人员正在利用这些失败作为他们自己工作的基石。”在155份研究论文的队列中，新的事实检查结合人工分析确定25%的论文具有序列错误。研究人员正在测试一组可疑的论文，所以虽然这个数字没有反映出基线错误率，但数字仍然令人吃惊。
“在一小组论文中，这是相当多的错误序列，不幸的是，鉴于核苷酸序列试剂已在成千上万的生物医学出版物中被描述，将会有更多的错误序列，”Byrne教授说。
研究人员发现，错误代表了身份错误(完全不正确的序列)和印刷错误(包含相当于拼写错误的序列)。作者提出序列识别错误可能代表研究欺诈的一个特殊标志，并可用于识别欺诈性论文和手稿。“我们希望像Seek&Blastn这样的工具能够前瞻性地阻止描述不正确的核苷酸序列试剂的出版物，并且可以标记现有的出版物，以便可以重新评估其结论，”Byrne教授说。
发现的错误包括：
序列试剂被认为是针对特定基因的，但实际上预测会靶向与该出版物中所述基因不同的基因，导致所获得的数据与所研究的系统无关。序列试剂不应该靶向任何基因(作为阴性对照)，而是预测靶向人类基因，这意味着研究人员不会将实验数据与正确的阴性对照进行比较。
序列试剂被认为是针对人类基因的，实际上似乎并不针对任何基因，这可能导致实验无效但研究人员不知道。
Byrne教授在2017年自然杂志评选的十大研究员中名声大噪，她的侦探工作揭示了在科学期刊上发表的欺诈性结果。到目前为止，她的工作导致了17次撤回，但她说这个过程缓慢而艰巨，期刊缺乏回应令人沮丧。在上个月的“自然”杂志的一篇社论中，她写道：“这些论文声称可以揭示大量癌症和罕见疾病背后的机制。它们可能会破坏识别易于测量的生物标志物的努力，用于预测疾病结果或药物是否有效。“我们创造了我们应得的文献。我们必须采取行动反对这种对有效科学的未被认可的威胁。”
标签： 医学研究
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