开源应用程序为活体动物创建细胞发育的超分辨率图像

根据圣母大学的一项研究，一种新工具可以让研究人员在细胞水平上看到生物体的更多生理状态。

发表在开发，研究表明一个开放源代码的应用程序，由巴黎圣母院研究人员创建了，怎么可以用在低激发功率获得创建一个两个不同的传统显微镜的图像高清晰度，三维图像。这个被称为DeSOS的应用程序结合了程序中使用的成像技术：盲解卷积(De)，它允许在某些情况下恢复模糊图像，以及逐步光饱和超分辨率(SOS)，一种有助于扩展分辨率超出其典型衍射极限。

完全，DeSOS使用物理学来识别两个上传图像之间的差异，并生成一个图像，其清晰度明显高于以前标准实验室设备的清晰度。

“这种开源应用程序允许科学家通过使用他们可能已经拥有的设备，共聚焦或双光子显微镜来提取超出之前可达到的分辨率的图像，”电气工程副教授兼共同领导Scott Howard说。作者对这项研究。“这不仅消除了购买超分辨率显微镜的费用，而且在评估生物体时，我们的程序也比超分辨率显微镜更快，功能更多。”在这项研究中，共同主要作者Cody J. Smith，Elizabeth和Michael Gallagher生物科学助理教授使用DeSOS来改进他对脊髓发育研究的成像。史密斯和他的团队分析了生长和延伸形成斑马鱼神经系统的特化细胞。通过该应用开发的图像使研究人员能够比共聚焦和双光子显微镜上的传统图像更好地观察斑马鱼神经系统的结构。

“由于DeSOS，我的实验室能够在斑马鱼脊髓发育过程中看到单个神经纤维，包括我们研究的组成部分，如果没有这项技术，我们无法清楚地认识到，”史密斯说。“我的实验室能够通过在我们的研究中加入这种开源应用程序，显着提高我们的成像能力并创造新的发现。”除了静止图像，这种DeSOS技术允许用户编辑来自生物体的时间流逝图像的视频。在这项研究中，霍华德和史密斯创建了一个视频，显示斑马鱼的神经纤维在发育过程中生长形成分支，最终向头部和后部延伸形成神经系统。

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