加利福尼亚州HERCULES - 2019年7月11日 - 科学家们在5月31日至6月4日在芝加哥举行的美国临床肿瘤学会(ASCO)年会上展示了30多篇采用Bio-Rad滴液数字PCR(ddPCR)技术的摘要。这些研究使用由ddPCR平台驱动的液体活检来测量循环肿瘤DNA(ctDNA)并评估ctDNA作为指导癌症治疗决策和预测疗效的生物标志物的潜力。
检测和分析液体活检样本中的ctDNA正在被认为是一种监测疾病进展的侵入性较小的方法。研究人员不仅测试各种癌症中的已知突变，还发现可能成为重要生物标志物的新突变。然而，更广泛的临床应用要求在各种癌症和临床条件下测试这些ctDNA生物标志物。以下研究强调了评估ctDNA作为监测治疗效果，肿瘤进展或肿瘤复发的潜在生物标志物载体的努力。
突变BRAF ctDNA是晚期黑素瘤治疗功效的潜在生物标志物
目前还没有经验证的基于血液的生物标志物用于监测晚期黑素瘤患者的治疗功效。纽约大学朗格医学中心的医学博士David Polsky和他的同事们正在研究ctDNA作为治疗这种疾病疗效的生物标志物的潜力。
研究人员在接受治疗的345名患者中检查了含有一种称为BRAF的突变基因的ctDNA，该基因通常与黑色素瘤有关。使用ddPCR技术，Polsky的团队能够确定ctDNA的基线浓度与此突变与患者存活率呈负相关。此外，Polsky发现，在治疗四周后，当突变的BRAF ctDNA水平降至不可检测的水平时，患者存活时间更长。
“我们可以进行这种定量分析的原因是因为ddPCR平台能够对样品中突变DNA的含量进行高度准确和精确的测量，”Polsky说。
ctDNA可能无法可靠地预测大脑中黑色素瘤转移的进展
悉尼麦考瑞大学和澳大利亚黑色素瘤研究所的医学博士Jenny Lee及其同事发现，当癌症特异性地转移到大脑时，使用ctDNA分析晚期黑色素瘤的进展存在局限性。
继早期研究之后，Lee及其同事使用ddPCR技术分析了48例晚期黑色素瘤和脑转移患者的ctDNA水平。所有患者均接受免疫检查点治疗。八个人的大脑有转移但其他地方没有。研究人员发现，在开始或治疗早期缺乏可检测的肿瘤ctDNA是一个好兆头。具体而言，它与优越的无进展生存期和总体生存期相关，但这不适用于在脑转移中观察到的反应。
至于为什么会出现这种情况，李指出，大脑中的转移可能比身体其他部位的转移小，并且血脑屏障可能在它到达血液之前滤除了ctDNA。
研究小组得出结论，尽管ctDNA可用于监测转移性黑色素瘤的治疗效果，但它可能无助于检测脑转移或监测脑肿瘤是否对免疫检查点治疗有反应。这项研究具有潜在的重要意义，因为多达一半的黑色素瘤患者在治疗的某个阶段出现脑转移。
无嵌合细胞的DNA可以追踪肝细胞癌中的肿瘤复发
三分之一的肝细胞癌(HCC)患者在手术后第一年内出现肿瘤复发。检测和跟踪复发性肿瘤对于医生在正确的时间实施治疗试验至关重要。
大多数HCC患者已感染乙型肝炎病毒(HBV)和港口病毒宿主(vh) - 嵌合体DNA，这是病毒DNA整合到HCC染色体中的结果。为了确定vh-嵌合体DNA是否可以作为比目前可用的测试更敏感的HCC进展生物标志物，TCM Biotech International Corporation的Ya-Chun Wang博士和他的同事使用ddPCR技术来量化血浆样品中的vh-嵌合体DNA在肿瘤切除手术前后的HBV相关HCC患者中。在50名患者中的44名患者中，研究人员在手术前检测并量化了vh-chimera DNA。
在手术后两个月血浆样本仍然含有vh-chimera DNA的患者中，82%的患者在第二年复发肿瘤。此外，在除了两名患者之外的所有患者中，vh-嵌合体DNA与原始克隆的DNA匹配，表明大多数复发来自原始HCC细胞。
作者指出，该发现支持vh-嵌合体DNA作为生物标志物，以补充现有的检测HBV-HCC的存在和基于vh-嵌合体克隆来追踪肿瘤复发。
“ddPCR检测为嵌合体DNA的敏感定量提供了优势，”Wang说。“在我们目前的实践中，血液中的目标嵌合体DNA可以被检测到每次反应低至一至两个拷贝。”
标签： 生物标志物
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