微生物谱支持人类肠道研究的增长领域

根据乔治华盛顿大学(GW)研究人员在PLOS ONE期刊上发表的研究，有157种生物形成了健康人体肠道的基线生物群落。如果考虑密切相关的蛋白质组，基线微生物谱，称为GutFeelingKB，可以扩展到863种生物。这些信息将作为医生，患者和研究人员的参考清单，让他们了解“正常”人类微生物组的样子。

“我们越了解人类微生物组，就越了解它对我们健康的重要性，”GW医学与健康科学学院的共同作者兼生物化学与分子医学教授Raja Mazumder博士说。“了解健康的人体肠道是什么样的，对于研究如何诊断，治疗和预防微生物群问题至关重要。”

在进行任何类型的临床前或临床研究之前，必须全面了解居住在健康人体肠道中的微生物的类型和比例。对于希望找到改变微生物组，治疗疾病或改善治疗结果的方法的研究人员来说，这也很重要。GutFeelingKB可以作为研究人类微生物组的健康控制。

为了编制他们的数据库，该研究小组对来自华盛顿特区招募的16名健康参与者的48份粪便样本进行了遗传测序，此外还使用了从人类微生物组项目下载的50个粪便宏基因组样本，这些样本也被筛选为健康人。在GutFeelingKB中描述的157种生物中，20%是梭菌，19%是芽孢杆菌，17%是肠杆菌，14%是肠杆菌，厚壁菌门20%是梭菌，14%是乳杆菌 - 益生菌中发现的所有细菌类别酸奶等食物。研究小组指出，所有样本中共有84种生物，这表明这组细菌可能是人类肠道的核心物种。

该研究得到了国家科学基金会，国家推进转化科学中心的临床和转化科学奖项计划，McCormick基因组和蛋白质组学中心以及GW和儿童国家的临床转化科学研究所(CTSI)的资助。华盛顿特区原始序列数据是在KamTek，Inc。生成的，使用MiSeq Illumina仪器在马里兰州罗克维尔的蒙哥马利学院进行补贴定价。

“这项研究展示了多学科团队科学推动转化研究的力量，因为该团队涉及来自GW内多个机构，学科和学校的同事，”CTSI资助的信息学联合负责人Keith A. Crandall博士说。作者，GW的米尔肯公共卫生学院计算生物学研究所所长。“GutFeelingKB提供了一个基础模型和初步数据，以开始了解健康肠道微生物组的多样性，这是任何试图检测与微生物组变化相关的疾病的研究的关键组成部分。”

除了创建GutFeelingKB之外，该研究小组还发表了一份名为FecalBiome的新型粪便生物群落人口报告，该报告具有临床应用能力。FecalBiome可以帮助医生将患者的微生物组与健康个体的微生物组进行比较，使他们能够更好地评估粪便移植物和其他微生物组产品的有效性。研究团队还为医生开发了一个原型报告模板，以便将信息传递给患者。

“揭示肠道微生物物种与人体宿主之间复杂的代谢交换对于各种各样的健康状况，甚至可能是我们的情绪都有着巨大的影响。微生物组可以”调整“以增加有益的细菌种群吗?我们的饮食如何影响这种调节“我们很高兴知识库将让我们量化这些变化，并将它们与人类健康联系起来，”Hiroki Morizo​​no博士说，他是CTSI资助的信息学联合负责人，共同作者，儿童国家和副研究教授的生物医学信息学主任GW医学与健康科学学院的基因组学，精准医学和儿科学。

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