得克萨斯州休斯敦-根据提出的调查结果，使用有限的变异筛选方法进行的直接面向消费者(DTC)基因测试的健康报告通常会产生临床假阴性结果，存在基于不完整信息告知医疗决策的风险在德克萨斯州休斯顿举行的美国人类遗传学会(ASHG)2019年年会上。
有限的变体筛选测试可提供关于一小套特定的遗传变化或变异的信息，众所周知，这些遗传变异或变异与疾病的风险有关。但是，每个基因都可以具有数千种与疾病相关的潜在变异。
Invitae的医学博士Edward Esplin解释说，虽然有限的变异体筛查可能有助于他们检测出变异体，但并非旨在检测与该疾病相关的每个变异体。“因此，这些健康报告可能会给人一种错误的保证感，未经确认测试，不得用于做出任何健康决定。”
在癌症风险筛查中量化测试的有效性
美国食品药品监督管理局(FDA)已授权从DTC遗传筛查中健康报告的销售，以了解乳腺癌，卵巢癌和结肠直肠癌的遗传风险。
他说：“我们研究的目的是量化由于有限的筛查策略和对验证性检测的需求而导致的临床假阴性，以帮助患者及其健康提供者了解如何处理临床护理结果。”
为此，Esplin博士及其同事专注于两项FDA授权的有限变体筛选测试，其中一项是针对MUTYH基因的，该测试可检测北欧人之间常见的两种与大肠癌相关的变体。其中一个针对BRCA1和BRCA2，可检测三种与乳腺癌相关的变异体，在Ashkenazi犹太血统的个体中常见。他们研究了由医疗保健提供者转介进行MUTYH基因测试的270,806名患者以及被转介给BRCA1 / 2基因测试的119,328名患者。
对于这两种测试，他们发现，如果只进行了有限的变体筛选，则大多数患者将收到临床假阴性结果。对于MUYTH，将错过40%的两个MUTYH基因突变的个体，这与几乎100%的终生结肠直肠癌风险相符。也将错过另外22%的一种MUTYH突变携带者，与大肠癌风险增加2倍相一致。正如预期的那样，对于BRCA1 / 2，所测试的变异在Ashkenazi犹太人中更为普遍。然而，即使在这些个体中，仍有19%的人会得到假阴性，而94%的非阿什肯纳兹犹太人的人都可能会遗漏BRCA1 / 2突变。
埃斯普林博士说：“临床假阴性结果可能会错误地使人放心，使患者无法根据自己的风险接受他们所需的预防性护理。这可能是预防癌症和发展为癌症的区别。”
了解人群之间的差异
Esplin博士的团队更深入地研究了结果，分析了不同种族背景的患者中的假阴性率。对于MUTYH，他们发现100%的亚洲人，75%的非裔美国人，46%的西班牙裔和33%的白种人会接受临床假阴性。同样，对于BRCA1 / 2，98%的亚洲人，99%的非裔美国人，94%的西班牙裔美国人和94%的白种人会接受临床假阴性。
标签： 基因测试
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