尽管在医学和科学领域做出了巨大努力,但全世界仍有40万人死于疟疾。感染性疾病是由被疟原虫疟原虫感染的蚊子叮咬传播的。寄生虫的基因组相对较小,大约有5,000个基因。
与人类细胞相比,疟原虫寄生虫每个基因只有一个拷贝。如果从寄生虫的整个基因组中去除一个基因,那么这将直接导致寄生虫表型的改变。由伯尔尼大学细胞生物学研究所(ICB)的Volker Heussler教授和瑞典于默奥大学的奥利弗·比尔克(Oliver Billker)以及以前在英国的桑格研究所(Sanger Institute)领导的国际财团利用了这一事实。研究人员已经对疟疾寄生虫进行了全基因组基因缺失研究:他们专门清除了1300多个个体基因,观察了该寄生虫整个生命周期的影响,从而能够确定病原体中的许多新靶标。本研究发表在著名期刊上单元格。
个别的遗传密码使研究加速了数十年
研究人员使用了伯尔尼大学细胞生物学研究所建立的疟疾小鼠模型。1300个寄生虫基因中的每个被一个单独的遗传密码所取代,以分析单个基因的去除如何影响该寄生虫。使用单独的代码可以同时研究许多寄生虫,从而大大缩短了分析时间。经过三年的研究,该国际财团成功地系统筛选了所有生命周期阶段的寄生虫基因组。这项研究的主要作者之一,来自ICB的Rebecca Stanway说:“与Sanger研究所共同进行的删除筛选使我们能够鉴定出数百个目标,特别是在寄生虫的代谢中。
模型计算扩展了实验结果
为了系统地分析大量已识别的代谢基因,伯尔尼研究人员与洛桑联邦理工学院的Vassily Hatzimanikatis教授和日内瓦大学的Dominique Soldati-Favre教授共同组成了“ MalarX”财团,该财团得到了瑞士国家科学基金会。使用疟疾基因组筛查的数据,EPFL的小组计算出了模型,这些模型显示了该寄生虫的基本代谢途径。“借助这些模型,现在可以预测哪些先前未开发的基因对寄生虫至关重要,因此是控制疟疾的合适靶标”来自洛桑州EPFL的模型专家Anush Chiappino-Pepe补充道。
然后,伯尔尼研究人员与荷兰莱顿大学的克里斯·詹斯(Chris Janse)教授密切合作,通过实验证实了其中一些预测。伯尔尼研究小组的Magali Roques说:“具有相应代谢模型的全基因组筛选代表了疟疾研究的一项突破。”桑格研究所前科学家埃伦·布谢尔博士(Ellen Bushell)补充说:“我们的研究结果将为全球许多疟疾研究人员提供支持。他们现在可以专注于基本的寄生虫基因,从而开发出针对寄生虫生命各个阶段的有效药物和疫苗。”
标签: 疟疾研究
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