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研究在癌症诊断中使用RNA测序替代免疫组织化学

导读莫斯科物理技术研究所的研究人员及其同事首次成功地将RNA测序用作免疫组织化学的替代品,用于癌症诊断。他们的研究发表在《生物医学》上。

莫斯科物理技术研究所的研究人员及其同事首次成功地将RNA测序用作免疫组织化学的替代品,用于癌症诊断。他们的研究发表在《生物医学》上。

用于癌症诊断的常规方法依赖于肿瘤组织切片的免疫组织化学染色。它可以检测恶性肿瘤生长的特征并检测其标记蛋白的浓度。该过程包括将肿瘤样品浸入热石蜡中。冷却后,将一块石蜡纸切成薄片,然后染色并用显微镜研究。所得图像表明肿瘤是否为恶性及其分子类型。此信息对于选择正确的疗法至关重要。

RNA测序的另一种方法涉及确定细胞中存在的每个RNA的序列和分子数。所得数据称为转录组,反映了细胞中所有基因的活性。为了分析如此大量的数据,生物信息学家采用专门的算法并为不同的人类细胞和组织编译转录组数据库。

最近发表在《生物医学》上的论文的作者提出,RNA测序可用作常规免疫组织化学染色的替代和补充技术。在这种方法下,相同的石蜡化肿瘤片段可用于分析。这意味着不需要额外的活检,并且这两种技术将很容易组合。

“我们首次证明这两种方法的发现与所选的生物标志物完全吻合。只是免疫组织化学需要大量的实验-每个考虑的生物标志物-意味着需要更多的生物材料反过来,RNA测序使我们能够定量表征所有蛋白质编码基因的工作,其中大约有20,000个!”首席研究员Anton Buzdin说,他是MIPT转化基因组生物信息学实验室的负责人,并领导了Oncobox的研究部门。

在他们的研究中,研究人员显示了通过RNA测序测量的四个肿瘤标志物基因的表达水平与免疫组织化学染色的结果之间存在明显的相关性。

Buzdin补充说:“我们坚信RNA测序在医学诊断领域具有广阔的前景。希望我们的最新研究使这一前景更加接近。”

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