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RNA-seq研究提供了对HIV疫苗接种保护的洞察力

在一项新的研究中,美国艾滋病研究计划(MHRP)在沃尔特里德陆军研究所领导的科学家在五个独立的HIV-1候选疫苗试验中确定了与SIV或HIV感染相关的B细胞转录特征。 。发现基因表达特征与之前显示适度功效的唯一人类HIV疫苗试验中的保护相关,RV144。该研究的结果发表在今天的Science Translational Medicine上。

此特征基因和特异性基因之前已被证实是针对人类的流感和黄热病疫苗接种而诱导的。“我们认为这种B细胞特征是疫苗接种后有效反应的广泛指标,可能有助于设计有效的HIV和其他病原体疫苗,”MHRP主持基因组学主任,该出版物的高级作者Rasmi Thomas博士说。 。更广泛地说,托马斯说,本研究中使用的RNA测序(RNA-Seq)方法可以证明是在其他临床和临床前试验中发现保护性相关性的有价值工具。

该研究检查了来自临床前HIV-1疫苗候选试验的RNA-Seq数据。研究人员假设在这些研究中观察到的部分功效可能是由于研究疫苗引起的宿主基因表达的变化。在HIV试验中首次使用称为RNA-Seq的新一代测序方法,他们在非人类灵长类动物中观察到了一种共同的保护性基因标记。

接下来,研究人员调查了这种B细胞特征是否与艾滋病毒感染的保护相关联,这是唯一一项显示适度疗效的临床人类HIV疫苗研究:由MHRP及其在泰国的合作伙伴进行的RV144试验。RV144使用了与非人类灵长类动物研究中使用的完全不同的疫苗Pox-蛋白质方案。

与临床前研究中的保护相关的B细胞特征也与RV144人疫苗效力试验中的保护以及NHP中的另外2种Pox蛋白疫苗相关。这种B细胞特征还与更高水平的功能性抗病毒抗体反应相关,称为抗体依赖性细胞吞噬作用,或ADCP,可以揭示疫苗为何具有保护作用。

“我们很兴奋,因为已鉴定的基因特征与目前正在非洲人体功效试验中测试的两种疫苗方案的保护效力,Imbokodo研究和HVTN702相关,”托马斯说。“这种新的保护相关性提供了以前疫苗为何部分保护的线索,可能有助于了解这些新研究中的功效机制。”

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